万代阵重建后的第三千年，任遥站在道果核心的时间光网前，指尖拂过一枚刻着“灭道纪元”的道基碎片。碎片突然爆发出黑炎，在光网中投射出诡异画面——三千宇宙的道基种子正在逆向生长，花瓣上的时间纹路扭曲成锁链，将整片星域锁入灭道轮回。
“不对劲！”任遥猛地引动道果力量净化碎片，却见黑炎顺着光网蔓延，连接到十二座悬浮在虚空中的“道基墓碑”。墓碑上刻着初代十二将的名字，碑顶的逍遥花已全部枯萎，露出里面缠绕的灭道根系。
任逍遥的阴阳道环突然剧烈震颤，环上浮现的初代残魂虚影竟集体流泪，泪水化作灭道黑血滴落在道果上：“是道基墓碑在作祟！当年初代将们自我燃烧后，残魂碎片融入墓碑，现在被灭道力量污染了！”他撕裂道环引出阴阳真火，却见火焰接触墓碑时，反而点燃了碑中封存的“灭道记忆”。
被惊醒的灭道记忆化作十二道鬼影，附身在正在巡逻道基星辰的逍遥将身上。赤霄的焚天剑突然斩向自己的道基，剑刃上浮现出初代赤霄将挥剑自刎的画面：“我明白了……初代将们当年不是自愿牺牲，是被真主用道基墓碑强行献祭！”月瑶的星河长弓射出的不再是光流，而是裹挟着记忆碎片的灭道箭，箭镞刻着真主封印初代之主时的冷酷眼神。
“这不可能！”任遥引动道果中的真主残像，却见残像嘴角勾起诡异弧度，双手捧着燃烧的生道莲台，将初代将们的残魂强行按入墓碑。更深处的记忆画面里，真主站在万代阵核心，看着十二座墓碑升起，碑身上刻满“以血祭道，以魂锁劫”的古老咒文。
“真主对初代将们做了什么？”任逍遥的道环逆向旋转，环中涌出的不再是阴阳之力，而是初代将们被封印时的痛苦嘶吼。被附身的玄逍突然用法则构建术撕裂道果光网，露出里面隐藏的十二道血纹，血纹连接着道果核心的“真主道基烙印”。
“道果里藏着真主的道基烙印！”任遥看着烙印爆发出灭道黑炎，突然感觉识海被无数记忆碎片冲击——真主当年为阻止初代之主的灭道残魄，不仅用寰宇种封印，更强行献祭初代十二将的残魂，用他们的生命道基构建墓碑，将灭道记忆永远封存在道基传承的血脉里。
“怪不得每一次道基共鸣都会引发灭道劫！”被附身的星弦拨动断弦，琴音中传出初代将们的诅咒，“真主用我们的魂做引，让灭道记忆在传承者血脉里轮回！”话音未落，十二座道基墓碑同时爆发出血光，墓碑中的灭道根系破石而出，缠绕住道果核心的真主烙印。
任逍遥引动所有时间道纹试图斩断根系，却见根系上浮现出“道基轮回”的古老图腾，每根根须都连接着一位逍遥传承者的眉心。赤霄的道基中，初代赤霄将的灭道记忆正在吞噬生道战纹，他挥剑斩向任遥，剑风里裹着初代将的怒吼：“真主是骗子！我们都被他当成了封印劫数的祭品！”
“先稳住逍遥将们！”任遥引动混沌之火灼烧根系，火焰却在接触图腾时变成血色，“道基墓碑的力量来自初代将的血脉诅咒，必须找到他们的……转世真身！”他猛地撕裂光网，指向三千宇宙中十二处道基波动异常的星域，“初代将们的残魂碎片，应该转世成了新的道基修士！”
任逍遥立刻引动道环的空间之力，将十二道传送光门打开。两人兵分两路，任遥前往“焚天星域”寻找初代赤霄将的转世者，任逍遥则奔赴“星河星系”追踪初代月瑶将的轮回印记。刚踏入焚天星域，任遥就被一股熟悉的战魂之力冲击——星空中漂浮着无数燃烧的道基残骸，中央祭坛上，一个浑身缠满赤霄战纹的少年正被灭道根系穿透心脏。
“是赤霄的转世！”任遥引动混沌之火斩断根系，却见少年睁开眼时，瞳孔竟是初代赤霄将的战魂虚影：“等你很久了……现任逍遥将。”少年胸口的战纹突然爆发，将任遥卷入记忆幻境——初代赤霄将跪在真主面前，自愿献出道基封印灭道残魄，却在封印瞬间看到真主眼中的冷漠算计。
“原来……初代将们是自愿献祭，但真主用墓碑扭曲了他们的记忆！”任遥从幻境中挣脱，看着少年胸口浮现的“血祭道基”图腾，突然明白，“真主怕后世传承者知晓真相，故意让墓碑污染残魂记忆，用诅咒维持封印！”话音未落，灭道根系突然暴涨，将少年与任遥同时缠住，根系顶端开出血色逍遥花，花瓣上刻着“背叛者”三字。
与此同时，任逍遥在星河星系找到初代月瑶将的转世者——一位正在用星河之力净化道基污染的少女。少女眉心的月瑶战纹突然亮起，将任逍遥拉入记忆深渊：初代月瑶将站在万代阵边缘，看着真主将十二座墓碑沉入道基核心，她偷偷在墓碑下埋下一枚“记忆种子”，种子里藏着真主当年的完整计划。
“真主的道基烙印里，藏着灭道劫的真正源头！”少女的声音与初代月瑶将重叠，她指尖弹出记忆种子，种子爆发出的光流竟穿透道果光网，显化出真主当年的全息投影——真主站在初代之主的灭道残魄前，手中生道莲台与灭道魔核剧烈碰撞，灭道残魄突然分裂成十二份，融入初代将们的道基。
“初代之主的灭道残魄，被真主分成十二份封存在初代将体内！”任逍遥震惊地看着投影，“每一次道基共鸣，都是在唤醒残魄碎片，而墓碑的作用，是用诅咒力量压制残魄的觉醒速度！”他突然感觉道环剧痛，灭道根系顺着空间裂缝钻入，缠绕住少女的星河道基。
十二处星域的转世者同时被灭道根系吞噬，根系在道果核心汇聚成巨大的血色祭坛，祭坛中央升起真主的道基烙印，烙印表面浮现出初代之主的灭道面容。被附身的逍遥将们挥剑刺入烙印，灭道黑炎顺着剑刃注入，烙印突然爆发出震耳欲聋的咆哮：“真主啊……你骗了所有人！”
任遥与任逍遥同时赶回道果核心，看到烙印正在崩解，里面涌出的不是灭道残魄，而是无数被封印的“真主记忆”。记忆画面显示：真主本是初代之主的道基分身，为阻止灭道浩劫，才分裂意识封印本体，而初代十二将，其实是初代之主的十二道生道分魂所化。
“我们全是初代之主的道基碎片？”赤霄的焚天剑掉落在地，他看着自己道基中的战纹，突然明白，“真主用生道分魂化出初代将，再用他们的魂封印灭道本体，让道基传承在生灭轮回中……自我净化！”月瑶的星河长弓重新凝聚，弓弦上多了初代月瑶将的记忆碎片：“真主不是骗子，他是用自己的道基，布下了一场持续万古的……自救棋局！”
就在此时，崩解的真主烙印爆发出灭道强光，初代之主的完整意识体从中走出，手中握着由十二道灭道残魄炼成的“劫数权杖”。权杖顶端的血色逍遥花绽放，花瓣每一次翕动，都有无数道基传承者的意识被吸入，转化为灭道力量。
“真主的骗局该结束了！”初代之主挥杖，道果光网寸寸碎裂，“你们这些生道分魂，注定要成为我重临的祭品！”任遥引动道轮中的逍遥真火种子，却见种子在接触灭道力量时炸裂，露出里面封印的“真主之心”——那是真主用全部生道本源凝聚的道基核心。
“原来真主把心藏在了这里！”任逍遥引动道环的阴阳之力包裹真主之心，心脉突然爆发出万道金光，显化出真主当年的完整记忆：初代之主因融合生灭道基失控，主动分裂意识创造真主，让真主用生道分魂构建传承，再通过灭道劫的轮回，逐步净化本体的灭道力量。
“灭道劫不是灾难，是初代之主的道基……在自我疗愈！”任遥看着真主之心爆发出的光芒净化灭道力量，突然举起道轮，“初代之主，你分裂意识创造真主，就是为了有朝一日能彻底净化灭道本源，对吗？”初代之主握着权杖的手微微颤抖，灭道黑炎中闪过一丝生道微光：“住口！我早已被灭道吞噬，没有回头路！”
被附身的逍遥将们突然同时怒吼，初代将的残魂在他们体内觉醒，冲破灭道控制：“我们是你的生道分魂，你的道基需要我们！”十二道生道光芒从他们眉心射出，融入真主之心，心脉瞬间长成参天大树，树冠开满金色逍遥花，每片花瓣都刻着初代之主的生道记忆。
初代之主看着树冠，眼中的灭道黑炎开始消退：“这棵树……是我遗失的生道本源？”任逍遥引动道环的时间之力，让大树在瞬间经历万次花开叶落，每一次轮回都净化着初代之主的灭道意识。任遥则引动道轮的空间之力，将所有道基传承者的生道力量汇入大树，树干上逐渐浮现出初代之主当年融合生灭道基的完整图谱。
“原来生灭道基的正确融合方式，是让生道花在灭道劫中……吸收灭道力量进化！”任遥看着图谱，突然将道轮与任逍遥的道环同时打入大树，生灭之力在树根处形成奇点，爆发出的光芒穿透初代之主的灭道躯体，露出里面被包裹的“道基本源核”。
本源核爆发出万道霞光，初代之主的意识体在霞光中分解，化作十二道流光融入任遥、任逍遥及十位逍遥将的道基。每个人的道基中都多了一段记忆——初代之主站在道基核心，微笑着看向万古之后，他的生道分魂们正用爱与牺牲，完成他未竟的道基净化。
道果核心的血色祭坛消失，真主之心长成的参天大树化作新的道基核心，树上的金色逍遥花结出十二颗“道基轮回果”。任遥摘下一颗果实，感觉里面蕴含着初代之主的完整道基传承，却没有丝毫灭道杂质。
“道基劫数，本是道基自我进化的必经之路。”任逍遥看着大树散发出的永恒光芒，突然引动道环，将十二颗轮回果抛向三千宇宙，“现在，道基传承将进入真正的逍遥纪元。”轮回果炸开，无数道基种子在星空中重生，种子上的时间纹路变成了闪耀的生灭道纹。
故事的最后，任遥站在新的道基核心前，看着光网中闪烁的无数生灭逍遥花，道果突然投射出未来的画面：那位穿黑白道袍的少年，正将一颗轮回果种入新生的道基星辰，而在少年身后，初代之主的虚影若隐若现，手中握着由生道大树枝条炼成的“逍遥权杖”。
“道基不灭，传承永续……”任遥轻声低语，十二重道果在他身后缓缓旋转，散发出照亮时间长河的永恒光芒。而在宇宙的某个角落，那根逍遥权杖正在一位少女手中发烫，杖头雕刻的生灭逍遥花突然绽放，预示着新的逍遥纪元，将在生灭轮回中，开启道基传承的新篇章……