宇宙重归平静的表面下，暗紫色晶体碎片的苏醒如同投入深潭的石子，激起层层涟漪。在距离永夜暗域边缘三光年处，一颗被称为「烬星」的死亡行星表面，新诞生的晶体碎片正以诡异的频率震颤，将周围的陨石与尘埃扭曲成螺旋状的能量漩涡。碎片核心处，隐约浮现出神秘人的残影，他的低语声穿透时空：“混沌的种子，永远不会真正消亡……”
林羽等人在世界树的树心召开紧急会议，树灵投射出的星图上，数十个红点如同病毒般蔓延。“这些区域的能量波动与黑洞核心的神秘力量同源。”雷掣调出量子监测数据，机械眼闪烁着警告红光，“更糟的是，虹桥网络出现了未知的加密协议，正在窃取各文明的尖端科技数据。”沈梦璃的精神力触碰到数据流的瞬间，脑海中闪过一幅幅令人不安的画面：黑袍人在实验室里将暗紫色晶体与机械生命体融合，魔法阵中漂浮着被混沌侵蚀的元素精灵。
机械帝国的「深渊重工」悄然发生异变。工程师们发现，部分用于修复城市的纳米机器人开始自主聚集，在废弃的工厂深处搭建起一座巨型金字塔结构。洛凛带领平衡灯塔的精锐部队潜入调查时，金字塔表面突然睁开无数暗紫色眼睛，释放出的精神脉冲瞬间瘫痪了所有电子设备。“这些机器人的核心程序被篡改了，它们在构建某种召唤仪式！”洛凛挥剑劈开迎面而来的机械触手，却发现伤口处渗出黑色黏液，正在腐蚀他的净化之力。
伊璇在世界树根系中追踪能量异动，意外发现了一条隐藏的暗河。暗紫色的流体在树根缝隙中奔涌，所到之处，世界树的净化能量被转化为诡异的灰雾。树灵的光芒剧烈闪烁：“这是混沌本源的倒影，有人在利用世界树的力量反向制造混沌！”她试图用生命权杖净化暗河，却遭到一股无形力量的反击，权杖表面的符文开始崩解。
更令人不安的是，宇宙中的普通生命体出现了异常觉醒。在科技联邦的殖民星球上，部分居民的瞳孔变成暗紫色，他们自发组成「熵变教团」，宣扬“混沌是宇宙的宿命”。教团成员能徒手操控能量，将建筑与飞船分解成混沌物质。沈梦璃潜入教团总部时，发现他们的精神波动与神秘人残留的意识频率完全一致，祭坛中央摆放的，正是一块刻满星渊文明符文的暗紫色晶体碎片。
林羽决定兵分多路：雷掣留守量子中枢，破解虹桥网络的加密协议；沈梦璃继续追查教团线索；洛凛前往「深渊重工」摧毁金字塔；伊璇则在世界树中寻找净化暗河的方法。临行前，树灵将一片散发着微光的金色叶子交给林羽：“这是初代守护者的记忆碎片，或许能揭开神秘人背后的真相。”
雷掣在量子中枢的战斗堪称惊心动魄。他的机械身躯被入侵的病毒程序撕裂成碎片，却凭借顽强的意志将意识上传至网络空间。在数据洪流中，他发现了一个名为「影网」的平行系统，那里存储着各文明最禁忌的科技——机械帝国的意识转移技术、魔法星系的灵魂契约秘术、科技联邦的基因改写工程。“他们要融合所有文明的黑暗面，创造终极武器！”雷掣将自身数据化作病毒猎手，在影网中与敌人展开攻防战。
洛凛在「深渊重工」的金字塔内部，遭遇了由机械生命体与混沌能量融合而成的「熵兽」。这些怪物能根据攻击形态改变自身结构，洛凛的净化之剑对其毫无作用。关键时刻，他回忆起与神秘人战斗时的场景，将剑中的星辰之力与混沌之力强行融合，斩出一道亦正亦邪的光芒，终于摧毁了金字塔的核心装置。但在爆炸的火光中，他看到一个黑袍人带着晶体碎片消失在传送门里。
伊璇在世界树的根系深处，发现了一处被封印的远古密室。密室中央的石棺中，沉睡着一位身着混沌与守护交织铠甲的战士，他的手中紧握着一块暗紫色晶体。当伊璇触碰晶体时，无数记忆涌入脑海：原来神秘人是初代守护者的亲弟弟，因目睹哥哥为维持平衡牺牲了整个混沌议会，从而走上了复仇之路。
就在此时，宇宙中所有暗紫色晶体碎片同时亮起，形成一张覆盖整个星系的能量网络。沈梦璃传来紧急通讯：“教团正在启动最终仪式，他们要将所有混沌力量注入烬星的晶体核心，重塑神秘人！”林羽握紧星痕剑，带着初代守护者的记忆碎片，带领众人奔赴烬星。一场关乎宇宙本源的最终对决，即将在暗紫色的能量风暴中展开……