巨型方舟划破宇宙的寂静，其表面流转的暗紫色熵化能量如同沸腾的熔岩，所经之处，星辰黯淡，时空扭曲成螺旋状的深渊。林羽等人驾驶着经过世界树能量强化的星舰，在方舟群的火力网中艰难穿行。沈梦璃的精神力不断遭受混沌意识的冲击，她却在混乱中捕捉到了神秘种族的集体记忆——原来他们来自熵海深处，是宇宙诞生前的无序能量所化，视一切规则为枷锁。
“他们要将宇宙还原成熵海的模样！”沈梦璃的声音在颤抖中带着决然，“本源熔炉是最后的防线，但锚点尚未全部激活！”雷掣的量子中枢在方舟群的电磁脉冲下濒临崩溃，他却意外发现，虹桥网络底层的秩序火种正在与熵晶产生共鸣。“如果能引导火种的能量冲击熵晶核心……”他将星舰的所有能量注入量子通道，在虚空中划出一道金色轨迹。
洛凛和伊璇在第三处锚点遭遇了神秘种族的首领分身。分身化作液态能量，瞬间将伊璇的生命藤蔓腐蚀殆尽。洛凛的净化之剑在混沌中失去效用，危急时刻，他将自身的守护意志与锚点残留的规则融合，剑身迸发出璀璨的秩序之光，斩碎了分身的同时，激活了锚点的防御系统。
林羽与沈梦璃终于抵达规则星的核心。这里漂浮着一枚水晶状的规则锚点，却被暗紫色的熵化茧层层包裹。沈梦璃以精神力为刃，强行撕开茧壳，林羽则挥出星痕剑，星辰之力与锚点共鸣，释放出能稳定时空的规则涟漪。然而，方舟群的主舰突然调转方向，直扑本源熔炉，首领的声音响彻整个宇宙：“秩序终将湮灭于熵海！”
在本源熔炉前，守护者们与方舟群展开最终决战。伊璇将世界树的根系化作金色巨网，试图束缚方舟的行动；雷掣引导的秩序火种如同一把利剑，刺入熵晶核心；洛凛的净化之剑与沈梦璃的精神力编织成防护盾，抵御着熵化能量的侵蚀。林羽握紧星痕剑，将自身的守护之力、初代守护者的记忆，以及各个文明的希望凝聚于剑尖，朝着方舟主舰冲去。
首领从主舰中现身，他的形态不断在混沌与秩序间转换：“你们以为靠这些就能阻止熵海的意志？”林羽的剑与他的熵化能量相撞，爆发出的能量风暴席卷整个星域。就在僵持之际，沈梦璃突然将所有锚点的规则之力导入星痕剑，剑身绽放出前所未有的光芒——那是融合了混沌、守护与秩序的终极力量。
“宇宙的精彩，正是因为矛盾与平衡的共存！”林羽的声音穿透能量乱流，一剑刺入首领的核心。首领的身体在光芒中逐渐消散，临终前，他的意识传来一阵震颤：“或许……我们真的错了……”方舟群失去控制，开始分崩离析，熵化能量也随之消散。
本源熔炉在规则之力的滋养下重新焕发活力，它将残余的熵化能量转化为纯净的宇宙本源，修补着被破坏的时空。世界树的根系遍布宇宙，金色的光芒治愈着每一处伤痕。星穹联盟决定在各个星域建立“平衡观测站”，由守护者们轮流驻守。
林羽等人站在世界树的树冠下，望着重生的宇宙。树灵的光芒温柔地包裹着他们：“混沌与秩序的博弈永无止境，但只要有守护的信念，宇宙就能在矛盾中不断进化。”远处的星空中，暗紫色晶体碎片的微光再次闪烁，却不再带着威胁的气息——那是宇宙对这场终章的纪念，也是新故事的序章。