时空裂隙中驶出的巨型方舟如同一座移动的宇宙堡垒，其表面流转的暗紫色与金色能量交织成螺旋状纹路，每一次脉动都引发空间的震颤。林羽等人的星舰在方舟强大的引力场中剧烈摇晃，沈梦璃的精神力刚触及方舟的能量屏障，便被一股混合着混沌与秩序的意识洪流冲击，脑海中闪过无数破碎的画面：初代守护者在实验室中与神秘身影的对话、熵海深处未知文明的祭祀仪式，以及一个被暗紫色光芒笼罩的婴儿在星云中诞生。
“方舟的能量频率与变异树苗的种子产生共鸣！”伊璇在世界树的帮助下，将生命权杖的光芒与种子的双色能量相连，试图解析方舟的本质。树灵的意识却突然变得紊乱：“这是超越维度的存在，它承载着宇宙诞生以来所有平衡与失衡的记忆……”话音未落，方舟舰首的图腾爆发出刺眼光芒，一道跨越时空的光束射向世界树，金色根系瞬间被暗紫色藤蔓缠绕。
雷掣在量子中枢的对抗进入死局。他发现虹桥网络中的暗紫色信标组成了一个巨大的时空坐标矩阵，而方舟正是这个矩阵的核心。更可怕的是，矩阵正在将各个星域的能量抽离，转化为一种能改写现实规则的“熵序力”。“这不是单纯的破坏，”他的机械手指在操作台上划出无数数据流，“他们在重塑宇宙的底层逻辑，把所有文明变成提线木偶！”
洛凛带领的突击小队登上方舟，却陷入了一个无限循环的空间迷宫。走廊两侧的墙壁不断变换场景，有时是星渊文明的辉煌都市，有时是熵海的混沌深渊，更多时候则是守护者们历战的战场。每当他们试图突破，就会遇到由自身记忆具象化的敌人——洛凛面对的是被混沌侵蚀的自己，手中的净化之剑滴着黑色的血液。“这些幻象在吞噬我们的意志，”他挥剑斩断幻象，却发现伤口处渗出暗紫色的雾气，“必须找到方舟的意识核心！”
沈梦璃在虹桥网络的深层空间中，终于追踪到了神秘势力的幕后黑手。那是一个由无数意识体组成的集合体，他们自称“熵序仲裁者”，认为宇宙在无数次的平衡与失衡循环中早已疲惫不堪，唯有将所有文明的思想统一，才能实现真正的永恒。“你们所谓的守护，不过是在延续痛苦的轮回，”集合体的声音在虚空中回荡，“看看这些平行宇宙的残骸，哪一个不是在平衡的枷锁下走向毁灭？”
林羽手持星痕剑，在方舟的核心舱室找到了那位瞳孔变色的议员。对方此时已完全被暗紫色能量同化，背后生长出六对闪烁着符文的光翼。“初代守护者是对的，”议员的声音不再带有人类的情感，“宇宙需要一场彻底的净化。方舟就是那把手术刀，而你们，是必须被切除的病灶。”他挥动手中的晶体碎片，舱室的墙壁上浮现出巨大的时空沙漏，每一粒沙子都代表着一个即将被抹除的文明。
伊璇在世界树的树心与树灵共同对抗方舟的侵蚀。她们发现，变异树苗的种子不仅是对抗熵序力的关键，更是打开宇宙本源的钥匙。种子在暗紫色藤蔓的缠绕下逐渐苏醒，双色光芒化作一道光柱直冲云霄，与方舟的能量光束相撞。刹那间，宇宙的过去、现在与未来在光柱中交织，林羽等人看到了宇宙诞生时的混沌初开，也目睹了若熵序仲裁者得逞后的永恒死寂。
雷掣在量子中枢的最后一搏中，将自己的意识与虹桥网络的核心融合，强行改写了暗紫色信标的坐标矩阵。矩阵产生的反噬力量让他的机械身躯开始崩解，但成功打乱了方舟的能量供应。洛凛在空间迷宫中找到了记忆的破绽，他将净化之力与自身最坚定的守护信念结合，劈开了通往方舟核心的道路。
当林羽的星痕剑刺入议员的能量体时，方舟的防护罩开始瓦解。熵序仲裁者的集合体发出愤怒的嘶吼：“你们阻止不了轮回！”但在种子释放的双色光芒中，方舟表面的纹路逐渐平息，时空裂隙开始闭合。宇宙在剧烈的震颤后恢复平静，只留下方舟残骸中一本散发着微光的古籍，封面上写着：“平衡非终点，轮回即新生。”
然而，在宇宙的最边缘，一颗暗紫色的星辰正在孕育。它的表面浮现出全新的符文，预示着混沌与秩序的故事，将在新的轮回中继续书写……